Die Hauptaufgabe der Zahlungsabwicklung besteht darin, den gesamten Zahlungsverkehr durchzuführen und zu verbuchen.
Hier werden sowohl die Einzahlungen zugeordnet als auch die Auszahlungen geleistet.

Die Überwachung des rechtzeitigen Eingangs der Forderungen der Stadt Warendorf ist ebenfalls hier angesiedelt. Bei nicht fristgerechter Leistung werden die Forderungen angemahnt (s. Mahnung).

Weiterhin werden hier die Buchungen des Lastschrifteinzugsverkehrs veranlasst.